PBX3
PBX3
Ідентифікатори
Символи
PBX3 , PBX homeobox 3
Зовнішні ІД
OMIM : 176312 MGI: 97496 HomoloGene: 21243 GeneCards: PBX3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес
• regulation of respiratory gaseous exchange by nervous system process • adult locomotory behavior • anterior compartment pattern formation • dorsal spinal cord development • neuron development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • posterior compartment specification • respiratory gaseous exchange by respiratory system • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 9: 125.75 – 125.97 Mb
Хр. 2: 34.06 – 34.26 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
PBX3 (англ. PBX homeobox 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 434 амінокислот , а молекулярна маса — 47 190[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDDQSRMLQT LAGVNLAGHS VQGGMALPPP PHGHEGADGD GRKQDIGDIL
HQIMTITDQS LDEAQAKKHA LNCHRMKPAL FSVLCEIKEK TGLSIRGAQE
EDPPDPQLMR LDNMLLAEGV SGPEKGGGSA AAAAAAAASG GSSDNSIEHS
DYRAKLTQIR QIYHTELEKY EQACNEFTTH VMNLLREQSR TRPISPKEIE
RMVGIIHRKF SSIQMQLKQS TCEAVMILRS RFLDARRKRR NFSKQATEIL
NEYFYSHLSN PYPSEEAKEE LAKKCSITVS QVSNWFGNKR IRYKKNIGKF
QEEANLYAAK TAVTAAHAVA AAVQNNQTNS PTTPNSGSSG SFNLPNSGDM
FMNMQSLNGD SYQGSQVGAN VQSQVDTLRH VINQTGGYSD GLGGNSLYSP
HNLNANGGWQ DATTPSSVTS PTEGPGSVHS DTSN
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Monica K., Galili N., Nourse J., Saltman D., Cleary M.L. (1991). PBX2 and PBX3, new homeobox genes with extensive homology to the human proto-oncogene PBX1 . Mol. Cell. Biol . 11 : 6149—6157. PMID 1682799 DOI :10.1128/MCB.11.12.6149
Milech N., Kees U.R., Watt P.M. (2001). Novel alternative PBX3 isoforms in leukemia cells with distinct interaction specificities. Genes Chromosomes Cancer . 32 : 275—280. PMID 11579467 DOI :10.1002/gcc.1190
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Lu Q., Wright D.D., Kamps M.P. (1994). Fusion with E2A converts the Pbx1 homeodomain protein into a constitutive transcriptional activator in human leukemias carrying the t(1;19) translocation . Mol. Cell. Biol . 14 : 3938—3948. PMID 7910944 DOI :10.1128/MCB.14.6.3938
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3
Стероїдні гормони[en]
Естроген-зв'язувальні
підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
The article is a derivative under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License .
A link to the original article can be found here and attribution parties here
By using this site, you agree to the Terms of Use . Gpedia ® is a registered trademark of the Cyberajah Pty Ltd