SSRP1

SSRP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4IFS
Ідентифікатори
Символи	SSRP1, FACT, FACT80, T160, Structure specific recognition protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604328 MGI: 107912 HomoloGene: 110735 GeneCards: SSRP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • nucleosome binding; • GO:0031493 histone binding;
Клітинна компонента	• ядерце; • нуклеоплазма; • хромосома; • клітинне ядро; • FACT complex;
Біологічний процес	• реплікація ДНК; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0100026 Репарація ДНК; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6749
	20833
	ENSG00000149136
	ENSMUSG00000027067
	Q08945
	Q08943
	NM_003146
	NM_001136081; NM_182990
	NP_003137
	NP_001129553; NP_892035
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SSRP1 (англ. Structure specific recognition protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 709 амінокислот, а молекулярна маса — 81 075^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAETLEFNDV	YQEVKGSMND	GRLRLSRQGI	IFKNSKTGKV	DNIQAGELTE
GIWRRVALGH	GLKLLTKNGH	VYKYDGFRES	EFEKLSDFFK	THYRLELMEK
DLCVKGWNWG	TVKFGGQLLS	FDIGDQPVFE	IPLSNVSQCT	TGKNEVTLEF
HQNDDAEVSL	MEVRFYVPPT	QEDGVDPVEA	FAQNVLSKAD	VIQATGDAIC
IFRELQCLTP	RGRYDIRIYP	TFLHLHGKTF	DYKIPYTTVL	RLFLLPHKDQ
RQMFFVISLD	PPIKQGQTRY	HFLILLFSKD	EDISLTLNMN	EEEVEKRFEG
RLTKNMSGSL	YEMVSRVMKA	LVNRKITVPG	NFQGHSGAQC	ITCSYKASSG
LLYPLERGFI	YVHKPPVHIR	FDEISFVNFA	RGTTTTRSFD	FEIETKQGTQ
YTFSSIEREE	YGKLFDFVNA	KKLNIKNRGL	KEGMNPSYDE	YADSDEDQHD
AYLERMKEEG	KIREENANDS	SDDSGEETDE	SFNPGEEEED	VAEEFDSNAS
ASSSSNEGDS	DRDEKKRKQL	KKAKMAKDRK	SRKKPVEVKK	GKDPNAPKRP
MSAYMLWLNA	SREKIKSDHP	GISITDLSKK	AGEIWKGMSK	EKKEEWDRKA
EDARRDYEKA	MKEYEGGRGE	SSKRDKSKKK	KKVKVKMEKK	STPSRGSSSK
SSSRQLSESF	KSKEFVSSDE	SSSGENKSKK	KRRRSEDSEE	EELASTPPSS
EDSASGSDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Bruhn S.L., Pil P.M., Essigmann J.M., Housman D.E., Lippard S.J. (1992). Isolation and characterization of human cDNA clones encoding a high mobility group box protein that recognizes structural distortions to DNA caused by binding of the anticancer agent cisplatin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 2307—2311. PMID 1372440 doi:10.1073/pnas.89.6.2307
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Orphanides G., LeRoy G., Chang C.-H., Luse D.S., Reinberg D. (1998). FACT, a factor that facilitates transcript elongation through nucleosomes. Cell. 92: 105—116. PMID 9489704 doi:10.1016/S0092-8674(00)80903-4
Dyer M.A., Hayes P.J., Baron M.H. (1998). The HMG domain protein SSRP1/PREIIBF is involved in activation of the human embryonic beta-like globin gene. Mol. Cell. Biol. 18: 2617—2628. PMID 9566881 doi:10.1128/MCB.18.5.2617
LeRoy G., Orphanides G., Lane W.S., Reinberg D. (1998). Requirement of RSF and FACT for transcription of chromatin templates in vitro. Science. 282: 1900—1904. PMID 9836642 doi:10.1126/science.282.5395.1900
Orphanides G., Wu W.-H., Lane W.S., Hampsey M., Reinberg D. (1999). The chromatin-specific transcription elongation factor FACT comprises human SPT16 and SSRP1 proteins. Nature. 400: 284—288. PMID 10421373 doi:10.1038/22350

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11327 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q08945 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11327 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q08945 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]